Jean-Jacques Aillagon a refusé au début du mois de janvier 2003 une proposition du président du Musée de Louvre de déplacer l'Union centrale des arts décoratifs regroupant le Musée de la Mode, le Musée de la Publicité et le Musée des Arts Décoratifs pour s'étendre dans le pavillon Marsan et l'aile du palais que ces institutions occupent actuellement. Le ministre de la Culture a ainsi décidé que Louvre n'occuperait donc pas tous ses bâtiments d'origine, du moins pas avant une vingtaine d'années et ce pour la simple raison que des travaux importants sont déjà prévus pour rénover une partie du Musée des Arts Décoratifs. De plus, le ministère se doit de mener à bien divers chantiers coûteux à travers le pays sans compter la reconstruction du château de Lunéville qui a été en grande partie détruit par le feu il y a deux semaines. Le budget de la Culture n'est donc pas extensible à souhait et les vœux du Président de la République de voir un département des arts de l'Islam être créé au Musée du Louvre risque ainsi d'être longtemps retardé.
Selon l'hebdomadaire "Le Canard Enchaîné", ce serait sur l'intervention de l'épouse du Président de la République que la décision de ne pas déplacer le Musée des Arts Décoratifs aurait été prise.